北京时间6月10日，本菲卡官方正式宣布，皇马支付1500万欧元解约金，穆里尼奥同意前往执教。

官方公告如下：
6月9日，里斯本与本菲卡足球体育股份公司再度向葡萄牙证券市场委员会（CMVM）发布官方公告：皇家马德里足球俱乐部正式敲定引进何塞・穆里尼奥的相关事宜，转会金额1500万欧元，该笔费用对应穆里尼奥当前有效执教合同中的解约条款，穆里尼奥本人已确认接受本次转会。

至此，穆里尼奥第二段执教本菲卡一线队的生涯正式落幕。

2025年9月18日下午，穆里尼奥在本菲卡训练基地完成亮相。时隔25年，这位教头再度回归这支素有“雄鹰”之称的俱乐部。两天后的9月20日，他迎来回归首秀：球队客场对阵AFS队，这是葡超联赛第6轮较量，本菲卡最终以3-0拿下比赛。

2025/26整个赛季，穆里尼奥率领本菲卡一线队共计出战45场正式比赛，取得27胜10平8负的战绩，全队累计攻入86球、丢39球。

葡超联赛中，他带队征战30轮赛事，球队最终斩获80个积分，位列联赛第三名；同时本菲卡也是本赛季葡超唯一一支保持不败的球队。
欧战赛场，穆里尼奥带队踢满9场比赛，率领球队一路闯入欧冠晋级1/8决赛的附加赛阶段。

国内杯赛方面：葡萄牙杯赛场本菲卡出战4场，止步四分之一决赛；葡萄牙联赛杯球队登场2次，最终止步半决赛。

2026年5月16日晚，安东尼奥・科英布拉・达莫塔球场的对决，成为穆里尼奥执教本菲卡的最后一场正式比赛。这是葡超第34轮（联赛收官战），本菲卡3-1击败埃斯托里尔，这场胜利也为穆里尼奥在本菲卡的执教生涯画上了句点。

里斯本与本菲卡俱乐部祝愿何塞・穆里尼奥未来一切顺遂。

据知名记者罗马诺透露，穆里尼奥与皇马签下了一份到2029年的合同。

现年63岁的穆里尼奥，曾在2010年7月至2013年6月执教皇马，期间战绩127胜28平23负，胜率71.3%，率队赢得1座西甲冠军、1座国王杯冠军、2座西超杯冠军。